As principais atividades desenvolvidas pela Subsecretaria de Rios e Canais consistem em:
- Limpeza e recuperação de caixas de ralo, drenagem, ramais, caixas de areia, poços de visita, canaletas, valas e galerias de águas pluviais;
- Limpeza de caixas de contenção de materiais sólidos e barragens de sedimentação e de regularização de vazão Substituições de grelhas e tampões;
- Atendimento emergencial em apoio ao Sistema de Defesa Civil e demolições de ruínas iminentes.